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国人乳腺癌患者基因图谱研究

作者: 来源: 发布时间:2020-12-23

中山大学孙逸仙纪念医院苏逢锡诊所专科联盟苏逢锡教授团队的“中国乳腺癌的基因图谱”临床研究成果在会上公布,有助于中国乳腺癌患者更大程度地实现精准治疗获益。

研究团队旨在探讨中国乳腺癌的基因组图谱特征,利用FoundationOne CDx基因检测技术针对141例原发性和43例复发/转移性(R/M)乳腺癌患者进行全面基因组测序(CGP),以鉴定患者所有类型的基因组改变,包括碱基取代、插入和缺失、重排和拷贝数变化等。结果发现184例患者中共有164个突变基因。突变频率>10%的前10个基因是:TP53(60.87%)、PIK3CA(39.67%)、ERBB2(25.00%)、AD21(16.30%)、CCND1(15.22%)、FGF3(14.67%)、FGF19(14.67 %)、FGF4(14.13%)、MYC(11.96%)、SD3(WHSC1L1)(10.87%)。

在原发性和R/M乳腺癌患者之间,有14个突变基因的差异为5%。R/M乳腺癌患者中TP53、ERBB2、RAD21、FGF19、FGF4、MYC、PTEN、BRCA1和RB1的突变频率较高,而原发性乳腺癌患者中PIK3CA、NSD3(WHSC1L1)、ZNF703、FGFR1和MDM2的突变频率较高。

该研究还分析了HR+/HER-、HR+/HER+、HR-/HER+、HR-/HER-这4种乳腺癌分子分型中突变频率>10%的基因,以探究具有不同近似分子亚型的乳腺癌患者之间基因突变类型的差异。结果发现在4种分子分型中,ERBB2、TP53、PIK3CA是中国乳腺癌患者最为常见的突变类型,且ERBB2在HR-/HER+患者中突变频率最高,TP53在HR-/HER-患者中突变频率最高,PIK3CA在HR+/HER-患者中突变频率最高。

研究还分析了中国乳腺癌患者重要通路相关的基因突变频率,包括ERBB通路(突变频率为63.59%)、PI3K-Akt信号通路(突变频率为52.17%)、p53信号通路(突变频率为66.85%)、细胞周期通路(突变频率为31.98%)、MAPK通路(突变频率为34.78%)、同源重组缺失(突变频率为20.65%),提示中国乳腺癌患者针对这些通路相关基因突变进行靶向治疗获益的比例会增加。

此外,与癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据相比,在中国乳腺癌患者发现了不同的ERBB2、PIK3CA、TP53变异位点。

该研究表明,中国原发性和复发/转移性乳腺癌患者之间,以及中国和其他种族乳腺癌患者间存在显著分子异质性。研究提供了中国乳腺癌患者的基因组图谱、突变特征和潜在的分子靶点的数据,对中国乳腺癌患者精确治疗有重要指导意义。

 (编撰 白蓉蓉)