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5个基因的分类法有望早期诊断胰腺癌

发表时间:2016-05-05

    多数胰腺癌患者诊断时已处于晚期,已无治愈的可能。Beth Israel Deaconess医学中心(BIDMC)研究团队发现并验证了一个5个基因分类法,可以有效准确地从非恶性组织中识别出早期胰腺癌。(Oncotarget. 2016年2月29日在线版)

    BIDMC蛋白质组学的基因组学、生物信息学和系统生物学中心主任及哈弗医学院副教授Towia Libermann表示,胰腺癌因其发病率接近死亡率,因此被认为是一种致命性的疾病。超过90%的胰腺癌患者在诊断时已发生转移并且治疗手段十分有限,早期诊断成为一种有效的延长胰腺癌患者生存的手段。虽然目前缺乏可靠的与胰腺癌相关的肿瘤标志物、早期指标及危险因素,但这种可以区分健康组织与恶性组织的方法为胰腺癌的早期诊断、早期治疗带来了希望。

    研究细节

    研究人员通过一些公开获得的胰腺癌基因表达数据集,研发了一种再次分析所有数据集的方法,并应用严格的统计学标准比较了不同平台及不同实验室之间的数据集。研究小组进一步选择一个亚数据集用来开发一个区别胰腺癌和健康胰腺组织的模板,并应用这一“胰腺癌预测指标”对其余的数据集进行独立的验证以证实该标志物的准确性。

    在独立验证5个胰腺癌基因预测模板可以区别癌症及正常组织后,研究者们将此预测模板进一步在包括胰腺良性病变(包括胰腺炎和早期胰腺癌)的数据集中进行验证。此预测模板可以准确区分出胰腺癌、良性胰腺病变、早期胰腺癌和健康胰腺组织。该预测模板在4个训练集中区分胰腺癌和非肿瘤样本的平均敏感性为95%,特异性为89%,在5个独立验证集显示有相似效能(敏感性94%,特异性90%)。

    BIDMC基因组学、蛋白质组学、生物信息学和系统生物学中心联合主任及HMS医学助理教授Manoj Bhasin表示:“我们应用创新性数据和基因选择方法,合并了多项基因研究的统计效能,且消除其变异性和批次效应,最终确定可靠的胰腺癌早期诊断生物标志物。”

    未来的应用

    BIDMC病理学助理教授Roya Khosravi-Far表示:“能精确区别晚期/早期胰腺癌与正常胰腺/良性胰腺病变的5个胰腺癌基因生物标志物模板有助于胰腺癌的早期诊断。我们的发现或许为胰腺癌的早期诊断提供了机会,使早期干预和更有效的治疗这一致命性疾病并提高患者生存率成为可能。”

    这个模板首选会应用于胰腺癌常规的细针穿刺活检标本的诊断分析,以及预测良性胰腺囊肿(有时是胰腺癌的先兆)的恶性潜质。另外,在提供了一个新的诊断工具的同时,这一方法或许还为研究胰腺癌如何发生提供新的视角。

    Libermann解释道,因为这5个基因在胰腺癌发病中如此早期地出现,可能是胰腺癌发生的驱动基因,或许可以成为相当有效的治疗靶点。TMPRSS4、AHNAK2、POSTN、ECT2和SERPINB5这5个基因大多与胰腺癌或其他癌症的迁移、浸润、粘附和转移相关。

    研究人员的下一步计划是在临床前瞻性研究中评价并验证这5个基因的诊断精确性。Libermann表示:“在未来,我们将探索将这个基于组织的诊断方法转变为无创性(血或尿)测试的可能性。”

    Bhasin补充表示:“为进一步增强这个生物标志物的诊断效能,我们计划利用包括胰腺癌相关的非编码RNA、蛋白、代谢产物和突变等一系列标志物来扩展标志物范围。这在同类生物标志物研发中史无前例,这类生物标志物从多基因角度测量胰腺癌的变化,以便作出高度准确的诊断。”

    (编译 白明 审校 巴一)