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研究者发现27种新的抑癌基因

发表时间:2017-11-20
作者:冯如

    比利时Leuven大学的研究者对12种人类肿瘤2218例肿瘤样本进行了杂合子缺失的检测,利用统计模型进行分析,发现了27种新的抑癌基因,有望为个体化治疗提供新的参考。(Nat Commun. 2017; 8: 1221)

    人类正常细胞内抑癌基因都是有两个拷贝,抑癌基因通过减缓分化和生长预防肿瘤发生,当抑癌基因缺失(通过突变等),肿瘤发生。不过要生成肿瘤,一个细胞内的抑癌基因两个拷贝都必须功能异常,因为如果有一个抑癌基因还有功能,还一息尚存,就照样还是能生成减缓细胞分化和生长的蛋白。要检测出抑癌基因两个拷贝的基因异常还是有挑战性的,一个问题是肿瘤都是有不同比例掺和的健康细胞和肿瘤细胞,这使得要确定肿瘤细胞中抑癌基因是一个还是两个缺失就比较困难。

    研究者建立了一个统计学模型,针对单核苷酸多态性进行分析,可以克服这一困难。研究者用这种方法发现了一众新的抑癌基因。研究者用这一模型分析了12种肿瘤的2218例样本的肿瘤细胞,包括乳腺癌肺癌结直肠癌卵巢癌和脑瘤。用这种方法可以分析样本中正常细胞和肿瘤细胞比例,这样就可以分析细胞中抑癌基因情况,以及肿瘤抑癌基因的DNA足迹,可以将这些基因与无害的基因突变区分开来。

    由此,研究者共发现了96种基因缺失,包括43种抑癌基因,其中27种是新发现的抑癌基因。可见,通过大通量分析肿瘤样本中的基因拷贝数,藉由计算机工具,研究者分析了一种发现肿瘤新基因的不错的方法。

    肿瘤是全球最大的健康负担之一,2012年全球约有1410万例新诊断肿瘤病例,肺癌乳腺癌结直肠癌是最常见的几大肿瘤。这一研究发现有望促进肿瘤个体化治疗的研究进程,这些新发现的抑癌基因有望为开发新的靶向治疗开道铺路。 

     (编译 冯如)