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CpG甲基化预测早期肝细胞癌的复发

作者: 来源: 发布时间:2017-03-06

中山大学肿瘤医院的Jiliang Qiu等报告的一项多中心研究结果显示,MSEH,一个以3个CpG岛为基础的甲基化,有助于预测早期肝细胞肝癌的复发。(J Clin Oncol. 2017年1月9日在线版)

虽然越来越多的早期肝细胞癌被确诊,但半数的确诊患者将会复发。因此,识别复发相关标志物已迫在眉睫。该研究调查了CpG甲基化预测早期肝细胞肝癌患者复发的有效性。

来自4个独立中心的共计576例早期肝细胞肝癌患者按三个阶段进行分类。在探索期,对66个肿瘤标本应用Illumina甲基化450k芯片进行分析。应用LASSO和回归特征消除法这两种算法来选取有显著意义的CpG岛。在训练集,应用Cox回归模型进一步缩小CpG岛到140个样本。在验证集,备选的CpG岛应用1个内部队列(141例)和2个外部队列(191例和104例)进行验证。

运用LASSO分析和回归特征消除法结合筛选出了46个CpG岛,其中3个CpG岛对应于SCAND3、Src同源3域的生长因子受体结合因子相互作用蛋白和肽酶抑制剂3,成为训练集的候选预测因子。在训练集中,基于这3个CpG岛上,发现MSEH(早期肝癌的甲基化特质)可以将患者区分为高/低风险复发组(P<0.001),同时在一个内部(P<0.001)和两个外部(P<0.001;P=0.002)验证集中得到验证。此外,一个由MSEH、肿瘤分化程度、乙型肝炎肝硬化、乙肝病毒表面抗原和抗病毒治疗构成的列线图训练集可以预测5年无疾病复发生存率,并且在其他三个验证集中也有良好的一致性(一致性指数分别为:0.725,0.697和0.693)。

(编译 佟琳琳 审校 宋娜 刘云鹏)