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哪些基因层面的机制导致了胆管细胞癌的不同分子亚型
作者：朱思娴、邱红、袁响林 来源： 发布时间：2017-11-14
新加坡Duke-NUS医学院的Jusakul等的报告揭示了遗传学、表观遗传学和环境致癌物质跨越不同基因位置而相互作用的机制，这种机制导致了不同分子亚型的胆管癌(CCA)。(Cancer Discov. 2017年7月30日在线版)
CCA是肝胆管细胞的恶性肿瘤，在肝吸虫感染流行国家有较高发病率。研究分析了来自10个国家的489例胆管癌，结合了全基因组(71例)、靶标/外显子、基因拷贝数、基因表达和DNA甲基化信息。
数据整合分析后确定了四种CCA亚型：肝吸虫阳性CCA(1/2亚型)中富含ERBB2扩增及TP53突变;而肝吸虫阴性CCA(3/4亚型)具有基因改变的拷贝数高，PD-1/PD-L2表达增加，或存在表观遗传学突变(IDH 1/2，BAP1)和FGFR/PRKA相关的基因重排。全基因组分析强调，FGFR2 3'UTR缺失是FGFR2上调的机制之一。
综合了蛋白质-DNA结合区域的非编码启动子突变的数据分析显示，CCA中普遍存在H3K27me3相关的调节位点。亚型1和亚型4具有明显不同的CpG岛DNA高度甲基化，或CpG岛周边高度甲基化。突变特征和亚克隆分析提示，这些亚型具有异于其他亚型的突变途径。
(编译 朱思娴 审校 邱红 袁响林)
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